Funkcję Pełnomocnika Prezydenta m.st. Warszawy pełni od kwietnia 2006 roku Marcin Wojdat.

Do głównych zadań Pełnomocnika, określonych w Zarządzeniu Nr 3384/2006 Prezydenta m.st. Warszawy z dnia 11 kwietnia 2006 roku, zmienionym Zarządzeniem Nr 4024/2010 Prezydenta m.st. Warszawy z dnia 5 stycznia 2010 roku, należy:

1. organizowanie współpracy o charakterze pozafinansowym z organizacjami pozarządowymi,
2. współpraca z Forum i Komisjami Dialogu Społecznego,
3. realizowanie polityki m.st. Warszawy w zakresie współpracy z organizacjami pozarządowymi (w oparciu o Uchwałę Nr LXII/1789/2005 Rady m.st. Warszawy z dnia 24 listopada 2005 r. w sprawie przyjęcia Strategii Rozwoju Miasta Stołecznego Warszawy do 2020 r.),
4. prowadzenie spraw związanych z ujednolicaniem procedur obowiązujących w poszczególnych komórkach organizacyjnych Urzędu m.st. Warszawy w zakresie współpracy z organizacjami pozarządowymi, w szczególności w zakresie udzielania dotacji,
5. pełnienie roli mediatora pomiędzy organizacjami pozarządowymi a m.st. Warszawą, w sytuacjach konfliktowych,
6. koordynowanie działań komórek organizacyjnych Urzędu m.st. Warszawy w zakresie współpracy z organizacjami pozarządowymi,
7. przygotowywanie projektów rocznych programów współpracy m.st. Warszawy z organizacjami pozarządowymi,
8. współtworzenie serwisu internetowego dla organizacji pozarządowych,
9. prowadzenie internetowej bazy adresowej organizacji pozarządowych oraz internetowej księgi dotacji,
10. monitorowanie zmian aktów prawnych dotyczących współpracy z organizacjami pozarządowymi oraz umieszczanie ich na stronie internetowej m.st. Warszawy,
11. reprezentowanie Prezydenta m.st. Warszawy na konferencjach i spotkaniach dotyczących problematyki sektora pozarządowego,
12. organizowanie spotkań z organizacjami pozarządowymi,
13. przedstawianie Prezydentowi m.st. Warszawy corocznych sprawozdań z działalności Pełnomocnika oraz wniosków ze współpracy m.st. Warszawy z organizacjami pozarządowymi,
14. przeprowadzenie oraz koordynacja naboru ekspertów zatrudnianych do oceny merytorycznej ofert składanych w trybie otwartych konkursów ofert na realizację zadań publicznych;
15. powoływanie zespołów ds. opiniowania ofert składanych w trybie otwartych konkursów ofert na realizację zadań publicznych, z wyłączeniem konkursów realizowanych przez dzielnice oraz konkursów ogłaszanych na podstawie ustawy o pomocy społecznej,
16. kontrola pracy zespołów opiniujących oferty składane w trybie otwartych konkursów ofert na zadania publiczne.

Obsługę organizacyjno-biurową Pełnomocnika zapewnia Centrum Komunikacji Społecznej Urzędu m.st. Warszawy.

Pełnomocnik w zakresie swojej działalności podlega bezpośrednio Prezydentowi m.st. Warszawy.